Allergier drabbar idag inemot halva befolkningen. Historikern Göran Graninger och medicinaren Bengt Björkstén utreder varför det dröjde ända till 1980-talet innan allergierna erkändes som folksjukdomar. Ingen vet varför allergierna har ökat, men mycket talar för ett samband med ändringar i livsstil och miljö. Forskningen om allergi har koncentrerats till ett tämligen smalt biomedicinskt fält. Samhället har uttryckt önskemål om att forskningen ger bred belysning av allergifrågorna. Detta synsätt möter motstånd från den traditionella allergiforskningen. Skall regering och riksdag, forskarsamhället eller den enskilde forskaren avgöra hur resurserna fördelas mellan olika områden? Finns gränser för forskarnas frihet? Kampen om allergiforskningen belyser en konflikt som pågått i över 100 år och som idag är aktuell på många för samhället viktiga forskningsområden.