Rån, misshandel, inbrott och försvunna personer är normala inslag i polisens vardag. Men i Stockholms förorter händer något annat och den lokala polisen tvingas hantera situationer som inte kan förklaras genom vanlig avrapportering; levande människor med lukt av död, kvinnomisshandlare som inte stoppas av dödlig verkanseld och mörka viskningar i radiosystemet.
I Blåljusens främmande baksida följer vi olika patruller från Stockholmspolisen och deras möte med en ny, oförklarlig vardag där varken aspiranter, assistenter eller inspektörer går säkra från det okända.