Det svarta regnet faller är den tredje och sista delen i romansviten om systrarna Isabella och Lina från Hven.
I Medan månen går vakt och Blinka lilla stjärna har vi fått följa flickornas tragiska uppväxt, Linas död och Isabellas svåra kamp för att få ett normalt liv. I Blinka lilla stjärna träffar hon Gino, upplever passion och blir kidnappad. När Gino blir mördad blir hon förälskad i polismannen Armand och de flyttar hem till Malmö.
I Det svarta regnet faller upptäcker Isabella att hon är gravid, hon gifter sig med sin Armand på släktgodset i Frankrike och får den manipulerande Stefanie till svärmor.
I familjekyrkan på godset i Frankrike döljer sig en fruktansvärd hemlighet som utsätter Isabellas och Armands förhållande för stora påfrestningar. Det tycks som Isabellas öde är en ständig kamp mot mörkrets makter. Men när hon ser det svarta regnet falla, tolkar hon det som ett omen och bestämmer hon sig för att lita på sin barnatro i ett försök att få harmoni.
Isabella och Armand tvingas fly till Italien för att undfly ett hot mot Isabellas liv. Men vistelsen i Italien utvecklar sig åt ett helt oväntat håll.